Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrprbP47758 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms