Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nedd4P46935 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nedd4P46935 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms