Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf1P46099 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms