Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms