Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf5P43027 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms