Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Mmp9P41245 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mmp9P41245 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mmp9P41245 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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