Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LtbP41155 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LtbP41155 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LtbP41155 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LtbP41155 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LtbP41155 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LtbP41155 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LtbP41155 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LtbP41155 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LtbP41155 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms