Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TtlP38585 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TtlP38585 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TtlP38585 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TtlP38585 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TtlP38585 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TtlP38585 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TtlP38585 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms