Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtprkP35822 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtprkP35822 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms