Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rfc1P35601 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms