Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6dP35459 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms