Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpardP35396 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpardP35396 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpardP35396 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpardP35396 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PpardP35396 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PpardP35396 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PpardP35396 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PpardP35396 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PpardP35396 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PpardP35396 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms