Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab23P35288 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms