Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptk2P34152 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptk2P34152 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms