Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nedd1P33215 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nedd1P33215 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms