Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou3f3P31361 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms