Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VtnP29788 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VtnP29788 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VtnP29788 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms