Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxrgP28705 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RxrgP28705 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms