Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RxraP28700 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RxraP28700 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RxraP28700 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RxraP28700 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms