Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BrafP28028 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BrafP28028 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BrafP28028 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BrafP28028 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BrafP28028 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BrafP28028 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BrafP28028 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BrafP28028 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms