Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2afxP27661 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afxP27661 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2afxP27661 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2afxP27661 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms