Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo2P25801 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms