Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd8P23463 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms