Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrkchP23298 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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