Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnnc2P20801 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnnc2P20801 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms