Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Fcer1aP20489 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fcer1aP20489 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fcer1aP20489 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fcer1aP20489 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Fcer1aP20489 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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