Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrkcaP20444 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms