Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TP20293 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TP20293 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TP20293 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TP20293 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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