Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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