Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd1P19182 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms