Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RargP18911 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RargP18911 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RargP18911 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RargP18911 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RargP18911 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RargP18911 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms