Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps6ka1P18653 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms