Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtpraP18052 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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