Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vpreb2P13373 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms