Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Defa1P11477 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms