Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lamp1P11438 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms