Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prf1P10820 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prf1P10820 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prf1P10820 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms