Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CatspereP0DP43 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms