Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf1P09925 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms