Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NclP09405 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NclP09405 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NclP09405 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NclP09405 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NclP09405 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NclP09405 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NclP09405 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms