Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ifna9P09235 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms