Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms