Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TtrP07309 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TtrP07309 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TtrP07309 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TtrP07309 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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