Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SparcP07214 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SparcP07214 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SparcP07214 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms