Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me1P06801 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me1P06801 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me1P06801 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me1P06801 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me1P06801 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me1P06801 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me1P06801 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Me1P06801 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me1P06801 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms