Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd4P06332 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd4P06332 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms