Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P06329 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P06329 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P06329 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P06329 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P06329 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P06329 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06329 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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P06329 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06329 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06329 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P06329 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06329 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06329 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P06329 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P06329 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P06329 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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P06329 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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P06329 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P06329 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06329 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P06329 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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