Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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