Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamc1P02468 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamc1P02468 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms