Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P01738 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P01738 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P01738 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms